- Archeologické nálezy potvrdily, že prvními obyvateli ostrova byl ilyrský kmen Liburnů, kteří tu žili od 9. stol. př. n. l.
- Své stopy tu zanechali také Římané (amfory, vrak lodi, antická nekropole, zbytky antické cesty).
- V raném středověku jeho vývoj ovlivnilo nedaleké starochorvatské město Nin, kde vládl král Petr Krešimir IV. V té době tu byly postaveny první kostely.
- Od 14. stol. byli pány ostrova Benátčané.
- V 16. stol. se Vir stal významným opěrným bodem v bojích s Turky.
- V 17. stol. přešel do rukou místní šlechty, několikrát měnil majitele až začátkem 20. století koupilo ostrov 89 místních rodin, ty si pak rozdělily půdu.
- Po 2. světové válce ostrov se stal součástí Jugoslávie a po roce 1993 definitivně přešel pod správu samostatného Chorvatska.
